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最低税与利得税不同，是一个独立的税种。适用实际纳税机制的纳税人需缴纳最低税，但是经柬埔寨发展理事会批准的合格投资项目可免于缴纳最低税。
若企业有妥善保存相关的会计记录，且每年有准备审计后的外部审计报告，可免于缴纳最低税。最低税的计税依据为提供服务和销售货物的营业收入（包括除了增值税以外的其他税金），税率为1%。该纳税年度应纳利得税大于该年度应纳最低税时，纳税人仅需就应纳利得税与最低税的差额缴纳税款。若该纳税年度应纳利得税小于该年度应纳最低税时，纳税人仅需缴纳利得税部分。
纳税人需事先提交税务机关审阅会计记录后，方能申请免征最低税优惠政策。税务机关每两年会对纳税人的会计记录进行审核。若纳税人认为税务机关的审核结果有误时，可向其申请进行二次审核。
柬埔寨境内企业或机构向居民企业支付费用时，应代扣代缴预提税，包括但不限于以下费用：
柬埔寨境内企业或机构向居民企业支付服务费用时，除非已开具有效的增值税发票，否则应按15%的税率代扣代缴预提税。
柬埔寨境内的非银行和储蓄机构的居民企业向居民企业支付利息时，应按15%的税率代扣代缴预提税。
柬埔寨境内企业或机构向居民企业支付特许权使用费时，应按15%的税率代扣代缴预提税。
柬埔寨境内企业或机构向居民企业支付租金时，应按10%的税率代扣代缴预提税。
柬埔寨境内的银行和储蓄机构向居民企业支付利息时，
（1）若其账户为定期存款账户，应按6%的税率代扣代缴预提税；
（2）若其账户为活期存款账户，应按4%的税率代扣代缴预提税。
特定商品和服务税是对进口商品或者特定商品和服务征收的税种，税率在3%至45%之间。
软饮料、含酒精饮料、香烟等产品以及从事娱乐、国内国际机票服务以及电信服务需缴纳特定商品和服务税。
从事土地、建筑物租赁的纳税人应缴纳土地和房屋租赁税。土地和房屋的租赁税以土地、房屋租赁收入为计税依据，税率为10%。
印花税是对特定的正式文书、特定的广告征收的税种，税额根据广告所设置的场所等因素确定。
转让空闲土地、重型和轻型卡车、轿车、摩托车、游艇等特定资产时，按照转让价值的4%缴纳印花税。
转让公司股权时，按照转让价值的0.1%缴纳印花税。
与政府签订货物购销合同或服务合同时，按照合同价值的0.1%缴纳印花税。
纳税人持有的在城市和指定地域的土地，没有在建设中、或者土地上的建筑物没有处于使用中时，应缴纳土地闲置税。具体税额于每年6月30日由未用土地评价委员会决定，按照每平方米土地的市场价格的2%计算，1,200平方米以内的土地免税。
车船税是在卡车、船舶等特定运输工具注册时征收。
自2007年1月1日起，柬埔寨正式实施征收酒店住宿税，税率为2%。计税基础为酒店费用，包括服务费以及除酒店住宿税和增值税以外的所有税费。
酒店所有者或代表人应在每月结束后的次月20日内申报缴纳酒店住宿税。
柬埔寨对生产、销售含酒精饮料、香烟的各个环节，按照货物价值（包括除了公共照明税以及增值税以外的其他所有税费）的3%，征收公共照明税。含酒精饮料及香烟的销售方，应在每月结束后的次月20日内申报缴纳公共照明税。
在转让车船、不动产所有权或土地使用权时，柬埔寨对财产承接方征收登记注册税。不同情况下的适用税率如下：
（1）对于转让不动产所有权及土地使用权，包括销售、赠予或以不动产投资等形式，适用税率为4%；
（2）转让各类运输工具的所有权，包括重型载货汽车、小汽车、摩托车、轮船、渡轮等，适用税率为4%；
（3）以下法律文书也将被征收登记注册税：
①与公司设立有关的法律文书，征收标准为1,000,000瑞尔；
②与公司并购有关的法律文书，征收标准为1,000,000瑞尔；
③与公司分立有关的法律文书，征收标准为1,000,000瑞尔。
（4）国家财政预算内的货物销售或服务采购合同，按合同金额的0.1%征收；
（5）转让部分或全部的公司股票，按股价的0.1%征收。