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1、在日本居住不超过1年的，只需对在日本取得的收入纳税；
2. 在日本居住超过1年但不到五年的，需对所有在日本取得的收入纳税，亦须就在海外取得并且汇入日本的收入纳税；
3. 在日本居住超过5年的，需对来自日本和海外的所有收入纳税；
4、有意永久居住在日本的，需对来自日本和海外的所有收入纳税。
日本个人所得税计算较为复杂，并且有一定的个税减免额，个人所得税大致可以由如下公式计算：
✍个人所得税=（个人收入-父母及配偶等抚养支出的扣除）×税率减去-减免额
| （个人收入-父母及配偶等抚养支出的扣除） | 个税税率 |
减免额 |
| 1,950,000JPY以下 | 5% |
0 |
| 1,950,000 JPY–3,300,000 JPY | 10% |
97,000JPY |
| 3,300,000 JPY –6,950,000 JPY | 20% |
427,000 JPY |
| 6,950,000 JPY –9,000,000 JPY | 23% |
636,000 JPY |
| 9,000,000 JPY–18,000,000 JPY | 33% |
1,536,000 JPY |
| 18,000,000 JPY–40,000,000 JPY | 40% |
2,796,000 JPY |
| 40,000,000 JPY + | 45% |
4,796,000 JPY |